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最新研究:新冠病毒11月中下旬人传人,华南市场非源头
来源:新京报网  时间:2020年2月22日22时  评论:【0】条 
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科研人员最新研究成果显示,武汉华南海鲜市场不是新冠病毒的起源地,新冠病毒可能最早于去年11月中下旬就输入武汉,并开始人际传播,在华南海鲜市场加快了人际传播。现在扩散的病例至少来自于3个途径。新型冠状病毒在2月12日之前发生过2次明显的种群扩张(分别是12月8日和1月6日)。

论文分析93个新冠病毒完整基因组

中科院西双版纳热带植物园副研究员郁文彬等人1月19日在中科院科技论文预发布平台chinaxi提交了一篇名为decoding the evolution and transmissions of the novel pneumonia coronavirus (sars-cov-2) using whole genomic data(基于全基因组数据解码新型冠状病毒进化和传播)的论文(1月21日重新提交)。

科研人员收集了全世界各领域共享到gisaid epiflutm数据库中覆盖了四大洲12个国家的93个新型冠状病毒样本的基因组数据(截至2月12日),通过全基因组数据解析,追溯传染源及扩散路径。

研究发现,收到的93个样本包含58种单倍型(可以理解为核酸链上决定同一性状的多个连锁基因构成的基因型),可以归纳为五组,包括3个古老超级传播者单倍型(h1,h3和h13)和2个新的超级传播者单倍型(h56和mv2)。其中,在中国样本中发现31个单倍型,在其他国家样本中发现31个单倍型。

单倍型演化关系显示,单倍型h13和h38是比较“古老的”单倍型,通过一个中间载体(mv1,可能是一个祖先单倍型,可能是来自中间宿主或者“零号病人”)与蝙蝠冠状病毒ratg13关联,并通过单倍型h3衍生出了单倍型h1。

郁文彬对媒体解释说,这是一种基于种群遗传学的分析方法。一种基因型不等于一个患者,一种新冠病毒单倍型携带者有可能是多人,甚至可能是上百人,比如h1单倍型就对应了19个样本,但是可以通过这个来溯源,因为某个单倍型患者意味着可能是来自同一个源传染。

华南市场的新型病毒是从其他地方传入的

研究发现,与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型都是h1及其衍生的单倍型h2,h8-h12,而一份武汉样品单倍型h3与华南海鲜市场无关。

h3 单倍型只有一个来自武汉的样本,与华南市场没有联系,而含有h3的其他样本则来自其他国家和地区。值得注意的是,华南市场的所有样本均具有 h1 单倍型或其衍生的单倍型(h2,h8-h12),这表明市场上短期内存在传播感染。华南市场中的新冠病毒可能是从其他地方传播的,或者至少华南市场没有病毒的原始来源。由于最早确定的受感染患者与市场没有联系,受感染的人很可能将新冠病毒传播给市场上的工人或卖家,然后迅速在市场上流通。拥挤的市场加速了病毒传播给买家,并于2019年12月上旬传播到整个城市,这与估计

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